Molti anni prima delle vicende raccontate nel film Dark Crystal del 1982, il pianeta Thra è in pericolo. Tre Gelfling, Rian, Brea e Deet, scoprono un segreto nascosto dai malvagi Skeksis, grazie al quale potrebbero distruggere il pianeta. Il cristallo della verità, infatti, che si trova nel cuore di Thra, è stato danneggiato proprio da loro e potrebbe contaminare tutto il pianeta con la sua malattia.
Nasce così il viaggio dei tre Gelfling, per organizzare una ribellione tesa a salvare il mondo e sconfiggere l’oscurità.